Uni-Lab-OS/.cursor/skills/batch-insert-reagent/SKILL.md

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name: batch-insert-reagent
description: Batch insert reagents into Uni-Lab platform — add chemicals with CAS, SMILES, supplier info. Use when the user wants to add reagents, insert chemicals, batch register reagents, or mentions 录入试剂/添加试剂/试剂入库/reagent.
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# 批量录入试剂 Skill

通过云端 API 批量录入试剂信息，支持逐条或批量操作。

## 前置条件（缺一不可）

使用本 skill 前，**必须**先确认以下信息。如果缺少任何一项，**立即向用户询问并终止**，等补齐后再继续。

### 1. ak / sk → AUTH

询问用户的启动参数，从 `--ak` `--sk` 或 config.py 中获取。

生成 AUTH token（任选一种方式）：

```bash
# 方式一：Python 一行生成
python -c "import base64,sys; print('Authorization: Lab ' + base64.b64encode(f'{sys.argv[1]}:{sys.argv[2]}'.encode()).decode())" <ak> <sk>

# 方式二：手动计算
# base64(ak:sk) → Authorization: Lab <token>
```

### 2. --addr → BASE URL

| `--addr` 值 | BASE |
|-------------|------|
| `test` | `https://uni-lab.test.bohrium.com` |
| `uat` | `https://uni-lab.uat.bohrium.com` |
| `local` | `http://127.0.0.1:48197` |
| 不传（默认） | `https://uni-lab.bohrium.com` |

确认后设置：
```bash
BASE="<根据 addr 确定的 URL>"
AUTH="Authorization: Lab <gen_auth.py 输出的 token>"
```

**两项全部就绪后才可发起 API 请求。**

## Session State

- `lab_uuid` — 实验室 UUID（首次通过 API #1 自动获取，**不需要问用户**）

## 请求约定

所有请求使用 `curl -s`，POST 需加 `Content-Type: application/json`。

> **Windows 平台**必须使用 `curl.exe`（而非 PowerShell 的 `curl` 别名），示例中的 `curl` 均指 `curl.exe`。

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## API Endpoints

### 1. 获取实验室信息（自动获取 lab_uuid）

```bash
curl -s -X GET "$BASE/api/v1/edge/lab/info" -H "$AUTH"
```

返回：

```json
{"code": 0, "data": {"uuid": "xxx", "name": "实验室名称"}}
```

记住 `data.uuid` 为 `lab_uuid`。

### 2. 录入试剂

```bash
curl -s -X POST "$BASE/api/v1/lab/reagent" \
  -H "$AUTH" -H "Content-Type: application/json" \
  -d '{
    "lab_uuid": "<lab_uuid>",
    "cas": "<CAS号>",
    "name": "<试剂名称>",
    "molecular_formula": "<分子式>",
    "smiles": "<SMILES>",
    "stock_in_quantity": <入库数量>,
    "unit": "<单位字符串>",
    "supplier": "<供应商>",
    "production_date": "<生产日期 ISO 8601>",
    "expiry_date": "<过期日期 ISO 8601>"
  }'
```

返回成功时包含试剂 UUID：
```json
{"code": 0, "data": {"uuid": "xxx", ...}}
```

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## 试剂字段说明

| 字段 | 类型 | 必填 | 说明 | 示例 |
|------|------|------|------|------|
| `lab_uuid` | string | 是 | 实验室 UUID（从 API #1 获取） | `"8511c672-..."` |
| `cas` | string | 是 | CAS 注册号 | `"7732-18-3"` |
| `name` | string | 是 | 试剂中文/英文名称 | `"水"` |
| `molecular_formula` | string | 是 | 分子式 | `"H2O"` |
| `smiles` | string | 是 | SMILES 表示 | `"O"` |
| `stock_in_quantity` | number | 是 | 入库数量 | `10` |
| `unit` | string | 是 | 单位（字符串，见下表） | `"mL"` |
| `supplier` | string | 否 | 供应商名称 | `"国药集团"` |
| `production_date` | string | 否 | 生产日期（ISO 8601） | `"2025-11-18T00:00:00Z"` |
| `expiry_date` | string | 否 | 过期日期（ISO 8601） | `"2026-11-18T00:00:00Z"` |

### unit 单位值

| 值 | 单位 |
|------|------|
| `"mL"` | 毫升 |
| `"L"` | 升 |
| `"g"` | 克 |
| `"kg"` | 千克 |
| `"瓶"` | 瓶 |

> 根据试剂状态选择：液体用 `"mL"` / `"L"`，固体用 `"g"` / `"kg"`。

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## 批量录入策略

### 方式一：用户提供 JSON 数组

用户一次性给出多条试剂数据：

```json
[
  {"cas": "7732-18-3", "name": "水", "molecular_formula": "H2O", "smiles": "O", "stock_in_quantity": 10, "unit": "mL"},
  {"cas": "64-17-5", "name": "乙醇", "molecular_formula": "C2H6O", "smiles": "CCO", "stock_in_quantity": 5, "unit": "L"}
]
```

Agent 自动为每条补充 `lab_uuid`、`production_date`、`expiry_date` 等字段后逐条提交。

Agent 循环调用 API #2 逐条录入，每条记录一次 API 调用。

### 方式二：用户逐个描述

用户口头描述试剂（如「帮我录入 500mL 的无水乙醇，Sigma 的」），agent 自行补全字段：

1. 根据名称查找 CAS 号、分子式、SMILES（参考下方速查表或自行推断）
2. 构建完整的请求体
3. 向用户确认后提交

### 方式三：从 CSV/表格批量导入

用户提供 CSV 或表格文件路径，agent 读取并解析：

```bash
# 期望的 CSV 格式（首行为表头）
cas,name,molecular_formula,smiles,stock_in_quantity,unit,supplier,production_date,expiry_date
7732-18-3,水,H2O,O,10,mL,农夫山泉,2025-11-18T00:00:00Z,2026-11-18T00:00:00Z
```

### 执行与汇报

每次 API 调用后：
1. 检查返回 `code`（0 = 成功）
2. 记录成功/失败数量
3. 全部完成后汇总：「共录入 N 条试剂，成功 X 条，失败 Y 条」
4. 如有失败，列出失败的试剂名称和错误信息

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## 常见试剂速查表

| 名称 | CAS | 分子式 | SMILES |
|------|-----|--------|--------|
| 水 | 7732-18-3 | H2O | O |
| 乙醇 | 64-17-5 | C2H6O | CCO |
| 甲醇 | 67-56-1 | CH4O | CO |
| 丙酮 | 67-64-1 | C3H6O | CC(C)=O |
| 二甲基亚砜(DMSO) | 67-68-5 | C2H6OS | CS(C)=O |
| 乙酸乙酯 | 141-78-6 | C4H8O2 | CCOC(C)=O |
| 二氯甲烷 | 75-09-2 | CH2Cl2 | ClCCl |
| 四氢呋喃(THF) | 109-99-9 | C4H8O | C1CCOC1 |
| N,N-二甲基甲酰胺(DMF) | 68-12-2 | C3H7NO | CN(C)C=O |
| 氯仿 | 67-66-3 | CHCl3 | ClC(Cl)Cl |
| 乙腈 | 75-05-8 | C2H3N | CC#N |
| 甲苯 | 108-88-3 | C7H8 | Cc1ccccc1 |
| 正己烷 | 110-54-3 | C6H14 | CCCCCC |
| 异丙醇 | 67-63-0 | C3H8O | CC(C)O |
| 盐酸 | 7647-01-0 | HCl | Cl |
| 硫酸 | 7664-93-9 | H2SO4 | OS(O)(=O)=O |
| 氢氧化钠 | 1310-73-2 | NaOH | [Na]O |
| 碳酸钠 | 497-19-8 | Na2CO3 | [Na]OC([O-])=O.[Na+] |
| 氯化钠 | 7647-14-5 | NaCl | [Na]Cl |
| 乙二胺四乙酸(EDTA) | 60-00-4 | C10H16N2O8 | OC(=O)CN(CCN(CC(O)=O)CC(O)=O)CC(O)=O |

> 此表仅供快速参考。对于不在表中的试剂，agent 应根据化学知识推断或提示用户补充。

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## 完整工作流 Checklist

```
Task Progress:
- [ ] Step 1: 确认 ak/sk → 生成 AUTH token
- [ ] Step 2: 确认 --addr → 设置 BASE URL
- [ ] Step 3: GET /edge/lab/info → 获取 lab_uuid
- [ ] Step 4: 收集试剂信息（用户提供列表/逐个描述/CSV文件）
- [ ] Step 5: 补全缺失字段（CAS、分子式、SMILES 等）
- [ ] Step 6: 向用户确认待录入的试剂列表
- [ ] Step 7: 循环调用 POST /lab/reagent 逐条录入（每条需含 lab_uuid）
- [ ] Step 8: 汇总结果（成功/失败数量及详情）
```

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## 完整示例

用户说：「帮我录入 3 种试剂：500mL 无水乙醇、1kg 氯化钠、2L 去离子水」

Agent 构建的请求序列：

```json
// 第 1 条
{"lab_uuid": "8511c672-...", "cas": "64-17-5", "name": "无水乙醇", "molecular_formula": "C2H6O", "smiles": "CCO", "stock_in_quantity": 500, "unit": "mL", "supplier": "国药集团", "production_date": "2025-01-01T00:00:00Z", "expiry_date": "2026-01-01T00:00:00Z"}

// 第 2 条
{"lab_uuid": "8511c672-...", "cas": "7647-14-5", "name": "氯化钠", "molecular_formula": "NaCl", "smiles": "[Na]Cl", "stock_in_quantity": 1, "unit": "kg", "supplier": "", "production_date": "2025-01-01T00:00:00Z", "expiry_date": "2026-01-01T00:00:00Z"}

// 第 3 条
{"lab_uuid": "8511c672-...", "cas": "7732-18-3", "name": "去离子水", "molecular_formula": "H2O", "smiles": "O", "stock_in_quantity": 2, "unit": "L", "supplier": "", "production_date": "2025-01-01T00:00:00Z", "expiry_date": "2026-01-01T00:00:00Z"}
```