--- name: batch-insert-reagent description: Batch insert reagents into Uni-Lab platform — add chemicals with CAS, SMILES, supplier info. Use when the user wants to add reagents, insert chemicals, batch register reagents, or mentions 录入试剂/添加试剂/试剂入库/reagent. --- # 批量录入试剂 Skill 通过云端 API 批量录入试剂信息,支持逐条或批量操作。 ## 前置条件(缺一不可) 使用本 skill 前,**必须**先确认以下信息。如果缺少任何一项,**立即向用户询问并终止**,等补齐后再继续。 ### 1. ak / sk → AUTH 询问用户的启动参数,从 `--ak` `--sk` 或 config.py 中获取。 生成 AUTH token(任选一种方式): ```bash # 方式一:Python 一行生成 python -c "import base64,sys; print('Authorization: Lab ' + base64.b64encode(f'{sys.argv[1]}:{sys.argv[2]}'.encode()).decode())" # 方式二:手动计算 # base64(ak:sk) → Authorization: Lab ``` ### 2. --addr → BASE URL | `--addr` 值 | BASE | |-------------|------| | `test` | `https://uni-lab.test.bohrium.com` | | `uat` | `https://uni-lab.uat.bohrium.com` | | `local` | `http://127.0.0.1:48197` | | 不传(默认) | `https://uni-lab.bohrium.com` | 确认后设置: ```bash BASE="<根据 addr 确定的 URL>" AUTH="Authorization: Lab " ``` **两项全部就绪后才可发起 API 请求。** ## Session State - `lab_uuid` — 实验室 UUID(首次通过 API #1 自动获取,**不需要问用户**) ## 请求约定 所有请求使用 `curl -s`,POST 需加 `Content-Type: application/json`。 > **Windows 平台**必须使用 `curl.exe`(而非 PowerShell 的 `curl` 别名),示例中的 `curl` 均指 `curl.exe`。 --- ## API Endpoints ### 1. 获取实验室信息(自动获取 lab_uuid) ```bash curl -s -X GET "$BASE/api/v1/edge/lab/info" -H "$AUTH" ``` 返回: ```json {"code": 0, "data": {"uuid": "xxx", "name": "实验室名称"}} ``` 记住 `data.uuid` 为 `lab_uuid`。 ### 2. 录入试剂 ```bash curl -s -X POST "$BASE/api/v1/lab/reagent" \ -H "$AUTH" -H "Content-Type: application/json" \ -d '{ "lab_uuid": "", "cas": "", "name": "<试剂名称>", "molecular_formula": "<分子式>", "smiles": "", "stock_in_quantity": <入库数量>, "unit": "<单位字符串>", "supplier": "<供应商>", "production_date": "<生产日期 ISO 8601>", "expiry_date": "<过期日期 ISO 8601>" }' ``` 返回成功时包含试剂 UUID: ```json {"code": 0, "data": {"uuid": "xxx", ...}} ``` --- ## 试剂字段说明 | 字段 | 类型 | 必填 | 说明 | 示例 | |------|------|------|------|------| | `lab_uuid` | string | 是 | 实验室 UUID(从 API #1 获取) | `"8511c672-..."` | | `cas` | string | 是 | CAS 注册号 | `"7732-18-3"` | | `name` | string | 是 | 试剂中文/英文名称 | `"水"` | | `molecular_formula` | string | 是 | 分子式 | `"H2O"` | | `smiles` | string | 是 | SMILES 表示 | `"O"` | | `stock_in_quantity` | number | 是 | 入库数量 | `10` | | `unit` | string | 是 | 单位(字符串,见下表) | `"mL"` | | `supplier` | string | 否 | 供应商名称 | `"国药集团"` | | `production_date` | string | 否 | 生产日期(ISO 8601) | `"2025-11-18T00:00:00Z"` | | `expiry_date` | string | 否 | 过期日期(ISO 8601) | `"2026-11-18T00:00:00Z"` | ### unit 单位值 | 值 | 单位 | |------|------| | `"mL"` | 毫升 | | `"L"` | 升 | | `"g"` | 克 | | `"kg"` | 千克 | | `"瓶"` | 瓶 | > 根据试剂状态选择:液体用 `"mL"` / `"L"`,固体用 `"g"` / `"kg"`。 --- ## 批量录入策略 ### 方式一:用户提供 JSON 数组 用户一次性给出多条试剂数据: ```json [ {"cas": "7732-18-3", "name": "水", "molecular_formula": "H2O", "smiles": "O", "stock_in_quantity": 10, "unit": "mL"}, {"cas": "64-17-5", "name": "乙醇", "molecular_formula": "C2H6O", "smiles": "CCO", "stock_in_quantity": 5, "unit": "L"} ] ``` Agent 自动为每条补充 `lab_uuid`、`production_date`、`expiry_date` 等字段后逐条提交。 Agent 循环调用 API #2 逐条录入,每条记录一次 API 调用。 ### 方式二:用户逐个描述 用户口头描述试剂(如「帮我录入 500mL 的无水乙醇,Sigma 的」),agent 自行补全字段: 1. 根据名称查找 CAS 号、分子式、SMILES(参考下方速查表或自行推断) 2. 构建完整的请求体 3. 向用户确认后提交 ### 方式三:从 CSV/表格批量导入 用户提供 CSV 或表格文件路径,agent 读取并解析: ```bash # 期望的 CSV 格式(首行为表头) cas,name,molecular_formula,smiles,stock_in_quantity,unit,supplier,production_date,expiry_date 7732-18-3,水,H2O,O,10,mL,农夫山泉,2025-11-18T00:00:00Z,2026-11-18T00:00:00Z ``` ### 执行与汇报 每次 API 调用后: 1. 检查返回 `code`(0 = 成功) 2. 记录成功/失败数量 3. 全部完成后汇总:「共录入 N 条试剂,成功 X 条,失败 Y 条」 4. 如有失败,列出失败的试剂名称和错误信息 --- ## 常见试剂速查表 | 名称 | CAS | 分子式 | SMILES | |------|-----|--------|--------| | 水 | 7732-18-3 | H2O | O | | 乙醇 | 64-17-5 | C2H6O | CCO | | 甲醇 | 67-56-1 | CH4O | CO | | 丙酮 | 67-64-1 | C3H6O | CC(C)=O | | 二甲基亚砜(DMSO) | 67-68-5 | C2H6OS | CS(C)=O | | 乙酸乙酯 | 141-78-6 | C4H8O2 | CCOC(C)=O | | 二氯甲烷 | 75-09-2 | CH2Cl2 | ClCCl | | 四氢呋喃(THF) | 109-99-9 | C4H8O | C1CCOC1 | | N,N-二甲基甲酰胺(DMF) | 68-12-2 | C3H7NO | CN(C)C=O | | 氯仿 | 67-66-3 | CHCl3 | ClC(Cl)Cl | | 乙腈 | 75-05-8 | C2H3N | CC#N | | 甲苯 | 108-88-3 | C7H8 | Cc1ccccc1 | | 正己烷 | 110-54-3 | C6H14 | CCCCCC | | 异丙醇 | 67-63-0 | C3H8O | CC(C)O | | 盐酸 | 7647-01-0 | HCl | Cl | | 硫酸 | 7664-93-9 | H2SO4 | OS(O)(=O)=O | | 氢氧化钠 | 1310-73-2 | NaOH | [Na]O | | 碳酸钠 | 497-19-8 | Na2CO3 | [Na]OC([O-])=O.[Na+] | | 氯化钠 | 7647-14-5 | NaCl | [Na]Cl | | 乙二胺四乙酸(EDTA) | 60-00-4 | C10H16N2O8 | OC(=O)CN(CCN(CC(O)=O)CC(O)=O)CC(O)=O | > 此表仅供快速参考。对于不在表中的试剂,agent 应根据化学知识推断或提示用户补充。 --- ## 完整工作流 Checklist ``` Task Progress: - [ ] Step 1: 确认 ak/sk → 生成 AUTH token - [ ] Step 2: 确认 --addr → 设置 BASE URL - [ ] Step 3: GET /edge/lab/info → 获取 lab_uuid - [ ] Step 4: 收集试剂信息(用户提供列表/逐个描述/CSV文件) - [ ] Step 5: 补全缺失字段(CAS、分子式、SMILES 等) - [ ] Step 6: 向用户确认待录入的试剂列表 - [ ] Step 7: 循环调用 POST /lab/reagent 逐条录入(每条需含 lab_uuid) - [ ] Step 8: 汇总结果(成功/失败数量及详情) ``` --- ## 完整示例 用户说:「帮我录入 3 种试剂:500mL 无水乙醇、1kg 氯化钠、2L 去离子水」 Agent 构建的请求序列: ```json // 第 1 条 {"lab_uuid": "8511c672-...", "cas": "64-17-5", "name": "无水乙醇", "molecular_formula": "C2H6O", "smiles": "CCO", "stock_in_quantity": 500, "unit": "mL", "supplier": "国药集团", "production_date": "2025-01-01T00:00:00Z", "expiry_date": "2026-01-01T00:00:00Z"} // 第 2 条 {"lab_uuid": "8511c672-...", "cas": "7647-14-5", "name": "氯化钠", "molecular_formula": "NaCl", "smiles": "[Na]Cl", "stock_in_quantity": 1, "unit": "kg", "supplier": "", "production_date": "2025-01-01T00:00:00Z", "expiry_date": "2026-01-01T00:00:00Z"} // 第 3 条 {"lab_uuid": "8511c672-...", "cas": "7732-18-3", "name": "去离子水", "molecular_formula": "H2O", "smiles": "O", "stock_in_quantity": 2, "unit": "L", "supplier": "", "production_date": "2025-01-01T00:00:00Z", "expiry_date": "2026-01-01T00:00:00Z"} ```