--- name: batch-submit-experiment description: Batch submit experiments (notebooks) to Uni-Lab platform — list workflows, generate node_params from registry schemas, submit multiple rounds. Use when the user wants to submit experiments, create notebooks, batch run workflows, or mentions 提交实验/批量实验/notebook/实验轮次. --- # 批量提交实验指南 通过云端 API 批量提交实验(notebook),支持多轮实验参数配置。根据 workflow 模板详情和本地设备注册表自动生成 `node_params` 模板。 ## 前置条件(缺一不可) 使用本指南前,**必须**先确认以下信息。如果缺少任何一项,**立即向用户询问并终止**,等补齐后再继续。 ### 1. ak / sk → AUTH 询问用户的启动参数,从 `--ak` `--sk` 或 config.py 中获取。 生成 AUTH token(任选一种方式): ```bash # 方式一:Python 一行生成 python -c "import base64,sys; print('Authorization: Lab ' + base64.b64encode(f'{sys.argv[1]}:{sys.argv[2]}'.encode()).decode())" # 方式二:手动计算 # base64(ak:sk) → Authorization: Lab ``` ### 2. --addr → BASE URL | `--addr` 值 | BASE | |-------------|------| | `test` | `https://uni-lab.test.bohrium.com` | | `uat` | `https://uni-lab.uat.bohrium.com` | | `local` | `http://127.0.0.1:48197` | | 不传(默认) | `https://uni-lab.bohrium.com` | 确认后设置: ```bash BASE="<根据 addr 确定的 URL>" AUTH="Authorization: Lab <上面命令输出的 token>" ``` ### 3. req_device_registry_upload.json(设备注册表) **批量提交实验时需要本地注册表来解析 workflow 节点的参数 schema。** 按优先级搜索: ``` /unilabos_data/req_device_registry_upload.json /req_device_registry_upload.json ``` 也可直接 Glob 搜索:`**/req_device_registry_upload.json` 找到后**检查文件修改时间**并告知用户。超过 1 天提醒用户是否需要重新启动 `unilab`。 **如果文件不存在** → 告知用户先运行 `unilab` 启动命令,等注册表生成后再执行。可跳过此步,但将无法自动生成参数模板,需要用户手动填写 `param`。 ### 4. workflow_uuid(目标工作流) 用户需要提供要提交的 workflow UUID。如果用户不确定,通过 API #2 列出可用 workflow 供选择。 **四项全部就绪后才可开始。** ## Session State 在整个对话过程中,agent 需要记住以下状态,避免重复询问用户: - `lab_uuid` — 实验室 UUID(首次通过 API #1 自动获取,**不需要问用户**) - `workflow_uuid` — 工作流 UUID(用户提供或从列表选择) - `workflow_nodes` — workflow 中各 action 节点的 uuid、设备 ID、动作名(从 API #3 获取) ## 请求约定 所有请求使用 `curl -s`,POST 需加 `Content-Type: application/json`。 > **Windows 平台**必须使用 `curl.exe`(而非 PowerShell 的 `curl` 别名),示例中的 `curl` 均指 `curl.exe`。 > > **PowerShell JSON 传参**:PowerShell 中 `-d '{"key":"value"}'` 会因引号转义失败。请将 JSON 写入临时文件,用 `-d '@tmp_body.json'`(单引号包裹 `@`,否则会被解析为 splatting 运算符)。 --- ## API Endpoints ### 1. 获取实验室信息(自动获取 lab_uuid) ```bash curl -s -X GET "$BASE/api/v1/edge/lab/info" -H "$AUTH" ``` 返回: ```json {"code": 0, "data": {"uuid": "xxx", "name": "实验室名称"}} ``` 记住 `data.uuid` 为 `lab_uuid`。 ### 2. 列出可用 workflow ```bash curl -s -X GET "$BASE/api/v1/lab/workflow/workflows?page=1&page_size=20&lab_uuid=$lab_uuid" -H "$AUTH" ``` 返回 workflow 列表,展示给用户选择。列出每个 workflow 的 `uuid` 和 `name`。 ### 3. 获取 workflow 模板详情 ```bash curl -s -X GET "$BASE/api/v1/lab/workflow/template/detail/$workflow_uuid" -H "$AUTH" ``` 返回 workflow 的完整结构,包含所有 action 节点信息。需要从响应中提取: - 每个 action 节点的 `node_uuid` - 每个节点对应的设备 ID(`resource_template_name`) - 每个节点的动作名(`node_template_name`) - 每个节点的现有参数(`param`) > **注意**:此 API 返回格式可能因版本不同而有差异。首次调用时,先打印完整响应分析结构,再提取节点信息。常见的节点字段路径为 `data.nodes[]` 或 `data.workflow_nodes[]`。 ### 4. 提交实验(创建 notebook) ```bash curl -s -X POST "$BASE/api/v1/lab/notebook" \ -H "$AUTH" -H "Content-Type: application/json" \ -d '' ``` 请求体结构: ```json { "lab_uuid": "", "workflow_uuid": "", "name": "<实验名称>", "node_params": [ { "sample_uuids": ["<样品UUID1>", "<样品UUID2>"], "datas": [ { "node_uuid": "", "param": {}, "sample_params": [ { "container_uuid": "<容器UUID>", "sample_value": { "liquid_names": "<液体名称>", "volumes": 1000 } } ] } ] } ] } ``` > **注意**:`sample_uuids` 必须是 **UUID 数组**(`[]uuid.UUID`),不是字符串。无样品时传空数组 `[]`。 --- ## Notebook 请求体详解 ### node_params 结构 `node_params` 是一个数组,**每个元素代表一轮实验**: - 要跑 2 轮 → `node_params` 有 2 个元素 - 要跑 N 轮 → `node_params` 有 N 个元素 ### 每轮的字段 | 字段 | 类型 | 说明 | |------|------|------| | `sample_uuids` | array\ | 该轮实验的样品 UUID 数组,无样品时传 `[]` | | `datas` | array | 该轮中每个 workflow 节点的参数配置 | ### datas 中每个节点 | 字段 | 类型 | 说明 | |------|------|------| | `node_uuid` | string | workflow 模板中的节点 UUID(从 API #3 获取) | | `param` | object | 动作参数(根据本地注册表 schema 填写) | | `sample_params` | array | 样品相关参数(液体名、体积等) | ### sample_params 中每条 | 字段 | 类型 | 说明 | |------|------|------| | `container_uuid` | string | 容器 UUID | | `sample_value` | object | 样品值,如 `{"liquid_names": "水", "volumes": 1000}` | --- ## 从本地注册表生成 param 模板 ### 自动方式 — 运行脚本 ```bash python scripts/gen_notebook_params.py \ --auth \ --base \ --workflow-uuid \ [--registry ] \ [--rounds <轮次数>] \ [--output <输出文件路径>] ``` > 脚本位于本文档同级目录下的 `scripts/gen_notebook_params.py`。 脚本会: 1. 调用 workflow detail API 获取所有 action 节点 2. 读取本地注册表,为每个节点查找对应的 action schema 3. 生成 `notebook_template.json`,包含: - 完整 `node_params` 骨架 - 每个节点的 param 字段及类型说明 - `_schema_info` 辅助信息(不提交,仅供参考) ### 手动方式 如果脚本不可用或注册表不存在: 1. 调用 API #3 获取 workflow 详情 2. 找到每个 action 节点的 `node_uuid` 3. 在本地注册表中查找对应设备的 `action_value_mappings`: ``` resources[].id == → resources[].class.action_value_mappings..schema.properties.goal.properties ``` 4. 将 schema 中的 properties 作为 `param` 的字段模板 5. 按轮次复制 `node_params` 元素,让用户填写每轮的具体值 ### 注册表结构参考 ```json { "resources": [ { "id": "liquid_handler.prcxi", "class": { "module": "unilabos.devices.xxx:ClassName", "action_value_mappings": { "transfer_liquid": { "type": "LiquidHandlerTransfer", "schema": { "properties": { "goal": { "properties": { "asp_vols": {"type": "array", "items": {"type": "number"}}, "sources": {"type": "array"} }, "required": ["asp_vols", "sources"] } } }, "goal_default": {} } } } } ] } ``` `param` 填写时,使用 `goal.properties` 中的字段名和类型。 --- ## 完整工作流 Checklist ``` Task Progress: - [ ] Step 1: 确认 ak/sk → 生成 AUTH token - [ ] Step 2: 确认 --addr → 设置 BASE URL - [ ] Step 3: GET /edge/lab/info → 获取 lab_uuid - [ ] Step 4: 确认 workflow_uuid(用户提供或从 GET #2 列表选择) - [ ] Step 5: GET workflow detail (#3) → 提取各节点 uuid、设备ID、动作名 - [ ] Step 6: 定位本地注册表 req_device_registry_upload.json - [ ] Step 7: 运行 gen_notebook_params.py 或手动匹配 → 生成 node_params 模板 - [ ] Step 8: 引导用户填写每轮的参数(sample_uuids、param、sample_params) - [ ] Step 9: 构建完整请求体 → POST /lab/notebook 提交 - [ ] Step 10: 检查返回结果,确认提交成功 ``` --- ## 常见问题 ### Q: workflow 中有多个节点,每轮都要填所有节点的参数吗? 是的。`datas` 数组中需要包含该轮实验涉及的每个 workflow 节点的参数。通常每个 action 节点都需要一条 `datas` 记录。 ### Q: 多轮实验的参数完全不同吗? 通常每轮的 `param`(设备动作参数)可能相同或相似,但 `sample_uuids` 和 `sample_params`(样品信息)每轮不同。脚本生成模板时会按轮次复制骨架,用户只需修改差异部分。 ### Q: 如何获取 sample_uuids 和 container_uuid? 这些 UUID 通常来自实验室的样品管理系统。向用户询问,或从资源树(API `GET /lab/material/download/$lab_uuid`)中查找。