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2026-05-20 11:17:48 +08:00
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@@ -0,0 +1,354 @@
# Peptide Station 新增两个节点:等待订单完成 + 人工下料
> 日期: 2026-05-20
> 目标文件: [peptide_station.py](../unilabos/devices/workstation/bioyond_studio/peptide_station/peptide_station.py)
> 参考实现:
> - [bioyond_cell_workstation.py](/Users/dp/python/yxz/unilabos/devices/workstation/bioyond_studio/bioyond_cell/bioyond_cell_workstation.py)`wait_for_order_finish`、`get_material_info`
> - [bioyond_rpc.py L782-800](../unilabos/devices/workstation/bioyond_studio/bioyond_rpc.py)`take_out`
> - 前端约束: [manual-confirm-detail.tsx](/Users/dp/go/code/Uni-Lab-Cloud/web/src/app/@enterprise/(new)/leap-lab/components/notification-draw/manual-confirm-detail.tsx)、[services/manual-confirm.ts](/Users/dp/go/code/Uni-Lab-Cloud/web/src/services/manual-confirm.ts)
> 状态: 仅需求草稿,不写代码
---
## 一、需求背景
`BioyondPeptideStation` 当前实验流程在 `start_experiment`manual_confirm 启动调度器)之后即结束,缺少:
1. **等待奔耀回报实验完成**:调度器跑完后,奔耀通过 LIMS 推送 `POST /report/order_finish` 回调;目前 peptide_station 没有把这条推送封装成 action 节点,下游无法在工作流图上"卡住"等结果,也拿不到 `usedMaterials` 等下游所需信息。
2. **下料引导**:实验完成后操作员需要把样品/产物从仓位里取出,下料前需要看到每个物料对应的 **仓库 / 坐标 (posX/posY/posZ) / 单位 / 物料名称**;下料完成后还需要回写一笔到奔耀(调用 `take-out` 接口),让奔耀清空相应库位状态。
因此在 `peptide_station.py` 增加两个 action 节点,串在 `start_experiment` 之后:
```
submit_experiment_dayN
→ start_experiment(manual_confirm 上料)
→ wait_for_order_finish (生成 unloadTable)
→ unload_materials (manual_confirm 下料 + 调 take-out)
```
---
## 二、关键设计决策
### D1. `unloadTable` 必须由节点 1 产出,不能放节点 2
前端 manual_confirm 弹窗(`manual-confirm-detail.tsx`)的数据来源只有两类:
| 数据 | 来源 | 用途 |
|------|------|------|
| `detail.schema` / `detail.uiSchema` | **当前**节点的 goal schema | 给操作员勾选的表单 |
| `previousNodeResult.data.param` | **上一个**节点输出 param`getPreviousNodeResult(task_uuid, node_uuid)` | 在弹窗里渲染表格、列表等只读信息 |
**前端拿不到节点 2 内部"半中间"生成的临时数据**——节点 2 一旦进入 manual_confirm 阻塞状态,它的 param 就只能是 `goal_default`(操作员勾选项),不能在阻塞前先调一次 `material-info`
→ 因此必须把 `material-info` 查询、`unloadTable` 组装全部前移到节点 1节点 1 在 LIMS 推送到达后立即查 `material-info`,把 `unloadTable` 作为输出 param 的一部分;节点 2 启动时前端自动通过 `getPreviousNodeResult` 拿到 `unloadTable` 渲染。
### D2. 节点 2 的执行时序:先人工下料,再调 take-out
节点 2 不是"调用 take-out 让奔耀帮忙下料",而是"操作员物理下料完成后,调 take-out 通知奔耀同步状态"。完整时序:
```
节点 2 (manual_confirm) 启动
前端弹窗显示 unloadTable + "确认下料完成" 按钮
▼ 操作员物理下料 (从仓位里取出样品)
▼ 操作员勾选 "已完成" → 点击"批准"
▼ POST /api/v1/lab/workflow/manual-confirm/action {action: "approve"}
▼ manual_confirm goal 解除阻塞 → 节点 2 函数体继续执行
▼ 调用 self.hardware_interface.take_out(order_id, preintake_ids, material_ids)
│ (= POST /api/lims/order/take-out, 文档见 docx/SUYVd65Ykov2prxsnOVcH5Eln7N)
节点 2 返回,下游继续
```
`take-out` 入参 `preintakeIds` / `materialIds` 由节点 1 输出的 `used_materials` 拆分得到(`preintakeId` 当前协议在 `usedMaterials` 中没有,全部传 `[]``materialIds` 来自每条 `usedMaterials.materialId`)。
---
## 三、节点 1`wait_for_order_finish`(等推送 + 预生成 unloadTable
### 行为
1. 入口先把 `order_code`(或从 `order_id` 反查到的 orderCode记入 `self.last_order_code`,并 `clear()` 一个 `threading.Event`
2. 阻塞在 `self.order_finish_event.wait(timeout=...)` 等 LIMS 推送。
3. 由基类 `WorkstationHTTPService._handle_order_finish_report``self.process_order_finish_report(report_request, used_materials)` 触发 pushpeptide_station **override** `process_order_finish_report`
- `super().process_order_finish_report(...)` 保留父类行为(`resource_synchronizer.sync_from_external()` 等)。
-`report_request.data` 存入 `self.last_order_report`orderCode 匹配时 `self.order_finish_event.set()`
4. 解除阻塞后,按 `data.status` 解析返回值(沿用 bioyond_cell 语义):`"30"→success` / `"-11"→abnormal_stop` / `"-12"→manual_stop` / 其它 `unknown_<status>` / 超时 `timeout`
5. **【关键新增】对每条 `usedMaterials.materialId` 调用 `self.hardware_interface.material_info(material_id)`**(带本地缓存避免重复请求),组装 `unloadTable`(结构见 §五)。`material-info` 接口失败的物料行 `whName/posX/posY/posZ/unit/materialName` 用空串占位,并把 materialId 追加到 `unload_summary.missing_material_info`**不抛异常**。
6.`order_id``order_code``order_finish_status``order_finish_report``used_materials``unloadTable``unload_summary` 一起作为输出 handle 暴露。
### 入参goal_default
| 参数 | 类型 | 说明 |
|------|------|------|
| `order_id` | `str` | 来自 `start_experiment` 输出 handle `order_id`(首选);用于回查 orderCode |
| `order_ids` | `List[str]` | 来自 `start_experiment` 输出 handle `order_ids`;多订单时按顺序逐个等 |
| `order_code` | `str` | 兜底入参CLI 调试时若已知 orderCode 可直接传 |
| `timeout_seconds` | `int` | 默认 `36000`10h与 bioyond_cell 一致 |
| `poll_mode` | `bool` | 默认 `False`;为 `True` 时改用 `wait_for_order_finish_polling` 风格0.5s 轮询,避免阻塞 ROS2 feedback 派发) |
### 输出 handles
| key | data_type | 说明 |
|-----|-----------|------|
| `order_finish_status` | `str` | `success` / `abnormal_stop` / `manual_stop` / `timeout` / `unknown_*` |
| `order_finish_report` | `json` | 完整 `report_request.data`,含 `orderCode/orderName/startTime/endTime/status/usedMaterials` |
| `used_materials` | `json` | 解析后的 `usedMaterials` 列表(每项 `materialId/locationId/typeMode/usedQuantity` |
| `material_ids` | `json` | `List[str]`,从 `used_materials` 抽出 materialId供节点 2 直接传给 `take-out` |
| `preintake_ids` | `json` | `List[str]`,当前协议为空列表,预留扩展点 |
| `unloadTable` | `table` | **下料表,前端在节点 2 manual_confirm 弹窗中通过 `getPreviousNodeResult` 拿到并渲染** |
| `unload_summary` | `json` | `{ "order_code": ..., "total_items": N, "missing_material_info": [materialId,...] }` |
| `order_id` / `order_code` | `str` | 透传给节点 2 |
### 接口依赖
| 接口 | 调用方式 | 用途 |
|------|----------|------|
| `process_order_finish_report` 钩子 | 基类已注册 | 接 LIMS push |
| `POST /api/lims/storage/material-info` | `self.hardware_interface.material_info(material_id)` | 查物料的 whName/posX/posY/posZ/unit |
### 实现要点(不写代码,仅设计)
- `BioyondPeptideStation.__init__` 末尾追加 `self.order_finish_event = threading.Event()``self.last_order_code = None``self.last_order_report = None`
- 新增 `process_order_finish_report` override`super().process_order_finish_report(...)`,再做 orderCode 匹配 + `set()`
- 抽内部辅助 `_build_unload_table(used_materials)`:参考现有 `_build_result_table` + `_resolve_wh_name_by_material_id` 的写法,加 `material_info_cache` 字典避免重复请求。
- 多订单(`order_ids` 长度 > 1按顺序逐个 wait最后把每个订单的 `usedMaterials` 合并成一张大表,附加 `orderCode` 列方便操作员区分;任何一个订单 `abnormal_stop` 立即返回 `abnormal_stop` 并把当前 report 一起带出。
- 装饰器 `@action(always_free=True, description="等待订单完成回调并预生成下料表", handles=[...])`
---
## 四、节点 2`unload_materials`(人工下料 + 调 take-out 同步)
### 行为
1. 接收节点 1 输出的 `order_id` / `material_ids` / `preintake_ids` / `unloadTable`unloadTable 前端会自动从上一个节点 param 渲染,节点本身只需要透传/兜底显示)。
2. 进入 `NodeType.MANUAL_CONFIRM` 阻塞,等操作员在前端:
-`unloadTable` 列出的每行物料 → 物理下料;
- 全部下料完成后,勾选 goal 表单中的 `materials_unloaded=True`
- 点击"批准"按钮,发 `POST /api/v1/lab/workflow/manual-confirm/action {action: "approve"}`
3. manual_confirm 解除阻塞后,节点函数体继续执行:
- 校验 `materials_unloaded == True`,否则抛 `RuntimeError("下料未确认,拒绝结束节点")`(与 `start_experiment` 中"未确认上料"处理一致)。
- 调用 `self.hardware_interface.take_out(order_id, preintake_ids=preintake_ids, material_ids=material_ids)`
-`take_out` 返回值(含 `code`/`message`)原样收进 `take_out_result``code != 1` 时记 warning 但不抛异常(已经物理下料,回写失败需要人工兜底,不应让节点失败)。
4. 返回 `{success, take_out_result, unloaded_count, ...}`
### 入参goal_default
| 参数 | 类型 | 说明 |
|------|------|------|
| `order_id` | `str` | 来自节点 1 输出 handle必填 |
| `material_ids` | `List[str]` | 来自节点 1 输出 handle必填 |
| `preintake_ids` | `List[str]` | 来自节点 1 输出 handle默认 `[]` |
| `unloadTable` | `table` | 来自节点 1 输出 handle本节点函数体几乎不用纯粹透传给前端弹窗前端走 `getPreviousNodeResult` 主动拉,节点本身仍 declare 这个 input handle 让连线显式可见) |
| `materials_unloaded` | `bool` | manual_confirm 占位字段,操作员勾选后置为 `True` |
| `timeout_seconds` | `int` | 默认 `3600`1h |
| `assignee_user_ids` | `List[str]` | 用 `placeholder_keys={"assignee_user_ids": "unilabos_manual_confirm"}` 占位 |
### 输出 handles
| key | data_type | 说明 |
|-----|-----------|------|
| `take_out_result` | `json` | `take-out` 接口原始响应 `{code, message, data}` |
| `unloaded_count` | `int` | 实际通知奔耀的物料数量(`len(material_ids)` |
| `success` | `bool` | `take-out` HTTP/业务都成功 → `True`;其余 `False` |
### 接口依赖
| 接口 | 调用方式 | 用途 |
|------|----------|------|
| `POST /api/lims/order/take-out` | `self.hardware_interface.take_out(order_id, preintake_ids, material_ids)` | 通知奔耀同步取出来源文档docx/SUYVd65Ykov2prxsnOVcH5Eln7N |
请求体格式(参考 [verify_bioyond_takeout_and_error.py L137-175](../scripts/verify_bioyond_takeout_and_error.py)
```json
{
"apiKey": "B10B5995",
"requestTime": "2026-05-20T10:50:00.123Z",
"data": {
"orderId": "<UUID>",
"preintakeIds": [],
"materialIds": ["<UUID-1>", "<UUID-2>"]
}
}
```
### 实现要点(不写代码,仅设计)
- 装饰器:
- `node_type=NodeType.MANUAL_CONFIRM`
- `placeholder_keys={"assignee_user_ids": "unilabos_manual_confirm"}`
- `goal_default={"materials_unloaded": False, "timeout_seconds": 3600, "assignee_user_ids": []}`
- `feedback_interval=300`
- 输入 handles 含 `order_id` / `material_ids` / `preintake_ids` / `unloadTable`
- `take-out` 失败时返回结构清晰,不要让节点抛异常打断工作流;让人工去 LIMS 后台手动复位。
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## 五、`unloadTable` 列定义(节点 1 产出,节点 2 仅透传)
| 列名(中文) | key | 数据来源 |
|--------------|-----|----------|
| 仓库名称 | `whName` | `material_info.locations[0].whName` |
| 坐标 X | `posX` | `material_info.locations[0].posX` |
| 坐标 Y | `posY` | `material_info.locations[0].posY` |
| 坐标 Z | `posZ` | `material_info.locations[0].posZ` |
| 单位 | `unit` | `material_info.unit`(顶层)或 `locations[0].unit` |
| 物料名称 | `materialName` | `material_info.name` |
> 多订单合并时在前面追加 `orderCode` 列。新增模块常量 `UNLOAD_TABLE_COLUMNS`,与现有上料确认表 `RESULT_TABLE_COLUMNS` 并存。
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## 六、端到端工作流连线
```mermaid
flowchart LR
submit["submit_experiment_dayN"] --> start["start_experiment<br/>manual_confirm: 上料"]
start -->|order_id, order_ids| wait["wait_for_order_finish<br/>① 阻塞等推送<br/>② 调 material-info 组装 unloadTable"]
wait -->|order_id, material_ids,<br/>preintake_ids, unloadTable| unload["unload_materials<br/>manual_confirm: 操作员下料<br/>→ 调 take-out 同步奔耀"]
bioyond["奔耀 LIMS"] -.HTTP POST /report/order_finish.-> wait
wait -.material-info.-> bioyond
unload -.take-out.-> bioyond
```
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## 七、影响面与兼容性
- **`peptide_station.py`** 增加:常量 `UNLOAD_TABLE_COLUMNS``__init__` 中事件字段、`process_order_finish_report` override、两个新 action、`_build_unload_table` 等私有方法。
- **基类 `station.py` 不动**override 中保留 `super().process_order_finish_report()` 调用。
- **HTTP 服务**:基类已自动启动,无需修改 `WorkstationHTTPService`
- **`bioyond_rpc.py` 不动**`take_out` / `material_info` 已封装。
- **测试** (`tests/test_peptide_station_contracts.py`):补 4 类用例
1. `process_order_finish_report` orderCode 匹配 / 不匹配场景下 event 是否被触发
2. `wait_for_order_finish` 在事件已 set 时立即返回,超时返回 `timeout`,且产出的 `unloadTable` 列顺序、字段名严格匹配
3. `wait_for_order_finish` 中某条 `material-info` 失败时,`unloadTable` 用空串占位 + `unload_summary.missing_material_info` 含该 materialId
4. `unload_materials``materials_unloaded=False` 时报错;`materials_unloaded=True` 时正确调用 `hardware_interface.take_out(order_id, preintake_ids, material_ids)`,并正确把响应放进 `take_out_result`
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## 八、待人类确认的开放问题
1. **过滤产物 vs 全量**`usedMaterials` 同时包含试剂、耗材、样品(`typeMode` 区分),下料表是否需要默认排除试剂/耗材?还是先全量列出,让操作员自己看?当前默认全量列出,列里带 `typeMode` 调试字段。
2. **失败重入语义**:若 `wait_for_order_finish` 超时,是否需要支持下一次启动该节点时"复用上一次推送"(即 event 已 set 时立即返回上一次 reportbioyond_cell 不支持,每次进入都会先 `clear()`;建议保持一致。
3. **`take-out` 失败的兜底**:当前设计是仅 warn 不抛异常。如果你希望失败必须阻塞工作流(避免奔耀仓位脏数据),改为抛 `RuntimeError`,让操作员重试或人工介入。
> 以上 3 点不阻塞节点骨架开发,可在实现阶段再问。
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## 附录 A`orderCode` 字段的作用与匹配语义
`orderCode` 是奔耀 LIMS 体系里**订单的"业务编号"**(字符串,如 `EXP260520-103045`),与 `orderId`UUID共存但用途不同。本设计里它有 4 个职责:
### A.1 创建订单时由 unilabos 端生成
`orderCode` **不是** LIMS 自动生成的,而是 peptide_station 在创建订单时本地拼出来后随请求体一起提交:
参见 [`peptide_station.py` `_build_order_identity`](../unilabos/devices/workstation/bioyond_studio/peptide_station/peptide_station.py)L1240 附近):
```python
def _build_order_identity(self, day_key: str, order_name_override: Any = None) -> Tuple[str, str]:
stamp = datetime.now().strftime("%y%m%d-%H%M%S")
order_code = f"EXP{stamp}"
...
```
随后 `_create_order_payload``orderCode` 放进 `create_order` 的请求体里。LIMS 收到后会持久化这个值,并在以后所有回推消息里带上它。
### A.2 它是 `/report/order_finish` 推送的"业务 key"
奔耀通过 `POST /report/order_finish` 推送回来时,`request.data` 里同时含有:
- `orderCode`(业务编号字符串,对应我们创建时填的)
- `orderName`(人类可读名称)
- `status`30 / -11 / -12 等)
- `usedMaterials[]`(每项含 `materialId``locationId``typeMode``usedQuantity`
`orderId` (UUID) 在 `create_order` 返回的 allocation_map 里以 key 形式给出,但 push 报文里通常不带或不可靠,**业务侧识别同一笔订单只能依赖 `orderCode`**。
### A.3 节点 1 用它做"多订单并发隔离"
工作站 HTTP 服务是**进程级单例**,所有 wait 节点共用同一条推送通道:
```
A 节点等 EXP-001 ─┐
B 节点等 EXP-002 ─┼─► /report/order_finish (单一进程入口)
C 节点等 EXP-003 (并行) ─┘
```
如果不按 `orderCode` 过滤,任何一笔订单完成都会唤醒所有 wait 节点,导致 A 节点拿到 B 节点的 report。因此节点 1 复刻 [`bioyond_cell_workstation.py` L168-170](/Users/dp/python/yxz/unilabos/devices/workstation/bioyond_studio/bioyond_cell/bioyond_cell_workstation.py) 的过滤模式:
```
进入 wait_for_order_finish:
self.last_order_code = <要等的 orderCode>
self.order_finish_event.clear()
self.order_finish_event.wait(timeout)
回调 process_order_finish_report:
if report.orderCode == self.last_order_code:
self.last_order_report = report
self.order_finish_event.set()
else:
# 不属于本次等待,忽略(或仅记日志)
```
`last_order_code` 是 peptide_station 实例上的 **互斥状态字段**,等价于"当前进程正在等的那一笔"。
### A.4 节点 1 入参允许传 `order_id` 的原因
`start_experiment` 的输出 handle 是 `order_id` / `order_ids`UUID上游工作流图里只能拿到 UUID。所以节点 1 设计成:
```
上游 order_id (UUID)
▼ 内部反查
get_order_report(order_id) → data.code (即 orderCode)
self.last_order_code = orderCode
进入阻塞等待
```
这层"UUID → orderCode"翻译对工作流编辑器用户透明。CLI 调试时若已经知道 orderCode也可以直接传 `order_code` 入参跳过反查。
### A.5 节点 2 中 `orderCode` 的角色
下料节点 **不参与匹配**,只做透传 + 日志:
| 用途 | 字段 |
|------|------|
| 日志 / 排错 | 节点函数日志中带上 orderCode |
| 多订单分组列 | `unloadTable` 中可选的 `orderCode` 列(多订单合并时) |
下料节点真正调用 `take-out` 时用的是 `orderId`UUID不依赖 orderCode。
### A.6 与其他 ID 字段的对照速查
| 字段 | 类型 | 谁生成 | 用在哪 |
|------|------|--------|--------|
| `orderCode` | 字符串(业务编号) | unilabos 端 (`_build_order_identity`) | `/report/order_finish` 匹配、人工排错 |
| `orderId` | UUID | LIMS 端 | LIMS 内部 API 入参(`get_order_report` / `reset_order_status` / `take-out` 等) |
| `orderName` | 字符串(中文名称) | unilabos 端 | 仅展示用 |
| `materialId` | UUID | LIMS 端 | `material-info` 查询、入/出库、`take-out.materialIds` |
| `locationId` | UUID | LIMS 端 | 入/出库、`reset_location` |
| `preintakeId` | UUID | LIMS 端 | `take-out.preintakeIds`(当前协议在 `usedMaterials` 中无对应字段,全部传 `[]` |
---
## 附录 B前端 manual_confirm 的数据通道(说明 D1 决策的来源)
参见 [`manual-confirm-detail.tsx`](/Users/dp/go/code/Uni-Lab-Cloud/web/src/app/@enterprise/(new)/leap-lab/components/notification-draw/manual-confirm-detail.tsx)
- `detail.schema` / `detail.uiSchema`:来自当前节点的 goal schema渲染表单`materials_unloaded` checkbox 在这里)。
- `previousNodeResult.data.param`:通过 [`services/manual-confirm.ts L20-28`](/Users/dp/go/code/Uni-Lab-Cloud/web/src/services/manual-confirm.ts) 的 `getPreviousNodeResult(task_uuid, node_uuid)`(即 `GET /api/v1/lab/workflow/task/{task_uuid}/node/{node_uuid}/param`)拿。当前前端只针对 `coin_cell_code` / `mount_resource` 做了硬编码渲染,但 param 里其它字段也都会一并下发,可被后续前端扩展直接使用。
→ 因此节点 1 把 `unloadTable` 写进自己的输出 param节点 2 manual_confirm 弹窗能拿得到;如果放节点 2 内部生成,前端就拉不到。